Вышедшие номера
Разработка алгоритмов сегментации в голографической микроскопии и томографии для определения морфологических параметров клеток
Переводная версия: 10.1134/S1063785019110191
AVB acknowledges the support of the Council of the President of Russian Federation for Support of Young Scientists and Scientific Schools (Project No. SP-2349.2019.4).
Белашов А.В.1, Горбенко Д.А.1,2, Жихорева А.А.1, Беляева Т.Н.3, Корнилова Е.С.3, Семенова И.В.1, Васютинский О.С.1
1Физико-технический институт им. А.Ф. Иоффе РАН, Санкт-Петербург, Россия
2Университет ИТМО, Санкт-Петербург, Россия
3Институт цитологии Российской академии наук, Санкт-Петербург, Россия
Email: belashov.andrey.93@gmail.com
Поступила в редакцию: 15 июля 2019 г.
Выставление онлайн: 20 октября 2019 г.

Разработаны алгоритмы сегментации клеток на двумерных фазовых изображениях и трехмерных распределениях показателя преломления, полученных соответственно методами цифровой голографической микроскопии и томографии. Алгоритмы оптимизированы для определения морфологических параметров клеток, в том числе объема, площади проекции, площади поверхности. Проведен сравнительный анализ погрешности определения объема клеток голографическими методами с использованием разработанных алгоритмов сегментации и эталонным методом конфокальной флуоресцентной микроскопии. Ключевые слова: голографическая микроскопия, голографическая томография, морфологические характеристики клеток, сегментация клеток.