Вышедшие номера
Оптимизация процесса лизиса для проточного выделения нуклеиновых кислот
Зайцева М.В. 1, Антифеев И.Е. 1, Петров Д.Г. 1, Есикова Н.А.1, Макарова Е.Д. 1
1Институт аналитического приборостроения Российской академии наук, Санкт-Петербург, Россия
Email: marishkask.mz@mail.ru
Поступила в редакцию: 19 мая 2023 г.
В окончательной редакции: 26 июня 2023 г.
Принята к печати: 30 октября 2023 г.
Выставление онлайн: 10 декабря 2023 г.

С целью сокращения времени без потери качества выделения нуклеиновых кислот изучено влияние параметров времени и температуры химического лизиса на результаты выделения ДНК E. coli. Определены и обработаны значения пороговых циклов (Ct) исследуемых проб, полученных путем выделения ДНК из бактерий E. сoli при различных параметрах лизиса: времени (5, 7, 9, 11, 13 и 15 min) и температуре (+45, +55, +65 и +75oC). Показана возможность сокращения времени лизиса на 67% (10 min) и снижения температуры для процесса лизиса клеток на 15% (10oC) без потери эффективности в сравнении с рекомендованными условиями (15 min, 65oС). Ключевые слова: ПЦР, пробоподготовка, лизис, температура, время. DOI: 10.61011/PJTF.2023.23.56847.176A
  1. M. Karlikow, K. Pardee, in Paper-based diagnostics, ed. by K.J. Land (Springer, Cham, 2018), p. 171. DOI: 10.1007/978-3-319-96870-4_6
  2. M.M. Rahman, A. Elaissari, Drug Discov. Today, 17 (21-22), 1199 (2012). DOI: 10.1016/j.drudis.2012.07.001
  3. Д.Г. Петров, Е.Д. Макарова, Н.А. Корнева, А.С. Альдекеева, Н.Н. Князьков, Науч. приборостроение, 25 (2), 91 (2015)
  4. I.M. Shehadul, A. Aryasomayajula, P.R. Selvaganapathy, Micromachines, 8 (3), 83 (2017). DOI: 10.3390/mi8030083
  5. E. Grigorov, B. Kirov, M.B. Marinov, V. Galabov, Micromachines, 12 (5), 498 (2021). DOI: 10.3390/mi12050498
  6. S.T. Harrison, Biotechnol. Adv., 9 (2), 217 (1991). DOI: 10.1016/0734-9750(91)90005-g
  7. B. Balasundaram, S. Harrison, D.G. Bracewell, Trends Biotechnol., 27 (8), 477 (2009). DOI: 10.1016/j.tibtech.2009.04.004
  8. A. Agarwal, C. Kumar, R. Goel, Indian J. Exp. Biol., 39 (9), 906 (2001)
  9. S.A. Thatcher, Clin. Chem., 61 (1), 89 (2015). DOI: 10.1373/clinchem.2014.221374

Подсчитывается количество просмотров абстрактов ("html" на диаграммах) и полных версий статей ("pdf"). Просмотры с одинаковых IP-адресов засчитываются, если происходят с интервалом не менее 2-х часов.

Дата начала обработки статистических данных - 27 января 2016 г.