ЖТФ, 2008, том 78, выпуск 6

 Содержание  Предыдущая статья  Следующая статья  Поиск  

Анализ капиллярно-электрофоретических систем секвенирования ДНК

А.Степухович, А.Цуприк, О.Кособокова, Д.Гаврилов, Б.Горбовицкий,
Г.Гудков, Г.Тышко, М.Черевишник, В.Горфинкель

Университет штата Нью-Йорк, Кафедра электроники и компьютерной техники,
11794 Стони Брук, США
e-mail: stepukhovich@mail.ru

(Поступило в Редакцию 5 июня 2007 г.)

Предложен метод характеризации и оптимизации систем секвенирования ДНК, основанных на капиллярном электрофорезе. Разработана модель, учитывающая взаимосвязь между длиной прочтения нуклеотидной последовательности и такими параметрами секвенирующих систем, как свойства разделяющей среды, длина капилляра, время инжекции, концентрация инжектированного образца ДНК, чувствительность детектирования, системный шум и мощность лазерного излучения. Оптимизация ДНК секвенирующих систем позволит определять наилучшие режимы пробоподготовки, инжекции и разделения, позволяющие прочитывать последовтельности требуемой длины. Предложенный метод применен для характеристики капиллярно-электрофоретических секвенирующих систем, использующих метод детектирования одиночных фотонов.

PACS: 82.45.Wx

 PDF версия (986Kb)   Другие выпуски  Другие журналы   Помощь 
Copyright (C) 2008, Коллектив авторов  Разработано...  webmaster