Журнал технической физики

Авторам

Правила оформления публикаций

Вышедшие номера

2025
- 1 2 3 4
2024
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2023
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2022
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2021
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2020
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2019
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2018
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2017
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2016
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2015
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2014
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2013
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2012
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2011
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2010
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2009
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2008
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2007
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2006
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2005
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2004
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2003
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2002
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2001
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2000
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
1999
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
1998
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
1997
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
1996
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
1995
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
1994
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
1993
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
1992
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
1991
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
1990
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
1989
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
1988
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

Математическое моделирование линейного докинга. I. Определение участков связывания между белковыми молекулами

DOI: 10.21883/JTF.2018.08.46301.2573

Переводная версия: 10.1134/S1063784218080108

Куликов К.Г.¹, Кошлан Т.В.²

¹Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, Санкт-Петербург, Россия Peter the Great Saint-Petersburg Polytechnic University, St. Petersburg, Russia

Peter the Great Saint-Petersburg Polytechnic University, St. Petersburg, Russia

²Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург, Россия St. Petersburg State University, St. Petersburg, Russia

Email: kulikov.kirill.g@gmail.com

Поступила в редакцию: 29 ноября 2017 г.

Выставление онлайн: 20 июля 2018 г.

PDF версия

Представлены результаты математического моделирования взаимодействия различных аминокислотных последовательностей белков Mdm2, Р53 и Nap1, согласно разработанным алгоритмам, с помощью которых были идентифицированы участки связывания различных белков при образовании ими биологических комплексов: Р53-Mdm2, Mdm2-Mdm2, Nap1-Nap1. Разработанный подход позволит определять активные участки связывания полипептидных цепей различных белков, а также подбирать и синтезировать высокоселективные пептиды, которые будут связываться в активном центре белка и приводить к его активированию или ингибированию и блокировке его биологических функций.

Системная компьютерная биология / Коллектив авторов. Монография. Новосибирск: Издательство СО РАН, 2008. 769 с
Betts M.J., Sternberg M.J. // Protein Eng. 1999. V. 12. P. 271-283
Пырков Т.В., Озеров И.В., Балицкая Е.Д., Ефремов Р.Г. // Биоорг. химия. 2010. Т. 36. N 4
Электронный ресурс. Режим доступа: http://www.uniprot.org/ (дата обращения 05.11.2017)
Thierry Soussi // EMBO Rep. 2010. Vol. ll. N ll. P. 822-826
Yingjuan Q., Xinbin C. // Methods Mol Biol. 2013. Vol. 965. P. 37-61
Zambetti G.P. The p53 Tumor Suppressor Pathway and Cancer. Springer, 2005
Yin Y., Solomon G., Deng C., Barrett J.C. // Mol. Carcinog. 1999. V. 24. N 1. P. 15-24
Manfredi J.J. // Genes. Dev. 2010. Vol. 24. N 15. P. 1580-1589
Park Y.J., Luger K. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2006. Vol. 103. N 5. P. 1248-1253
Leslie P.L., Ke H., Zhang Y. // J. Biol. Chem. 2015. Vol. 290. N 20. P. 12941-12950
Jayne Loughery J., Meek D. // BioDiscovery. Vol. 8. N I. P. 1-20
Freedman Deborah A., Arnold J.L. // Mol. Cell. Biol. 1998. Vol. 18. N 12. P. 7288-7293
Dingding Shi, Wei G. // Genes. Cancer. 2012. Vol. 3. N 3-4. P. 240-248
Grossman S.R., Perez М., Kung A.L., Joseph М., Mansur C., Zhi-Xiong X., Sushant K., Livingston D.M. // Mol. Cell. 1998. Vol. 2. N 4. P. 405-415
Petrenko O. // M0I. Cancer. Res. 2003. Vol. l. N 14. P. 1001-1008
Golestanian S., Sharifi A., Popowicz G.M., Azizian H., Foroumadi A., Szwagierczak A., Holak T.A., Amanlou M. // Life. Sci. 2016. Vol. 145. P. 240-246
Poyurovsky M.V., Priest С., Kentsis A., Borden K.L., Pan Z.Q., Pavletich N., Prives C. // EMBO J. 2007. Vol. 26. N 1. P. 90-101
Zlatanova J., Seebart C., Tomschik M. // FASEB J. 2007. Vol. 21. N 7. P. 1294-1310
Jiandong C. // Transl. Cancer. Res. 2016. Vol. 5. N 6. P. 639-649
Fenley A.Т., Adams D.A., Onufriev A.V. // Biophys. J. 2010. Vol. 99. P. 1577-1585
Семчиков Ю.Д. Высокомолекулярные соединения. М.: Академия, 2010
Gerstein М., Richards F.M. Protein Geometry: Volumes, Areas, and Distances. Yale University, 1977
Biro J.C. // Theoterical Biology and Medical Modelling. 2006. Vol. 3. N 15. P. 1-12
Almazov A.B. Probabilistic Methods in the Theory of Polymers M.: Science, 1971
Ryskin Ya.I. Hydrogen Bond and Structure of Hydrosilicates. L.: Science, 1972
Kulikov K.G., Koshlan T.V. // Technical Physics. 2001. Vol. 61. N 10. P. 1572-1579
Саранин В.A. // УФН. 1999. Т. 169. С. 453-458
Саранин B.A. // УФН. 2002. Т. 172. С. 1449-1454
Саранин В.А. // УФН. 2010. Т. 180. С. 1109-1117
Смайт В. Электростатика и электродинамика. Перевод со второго американского издания А.В. Гапонова и М.А. Миллера. M.: ИЛ, 1954
Щерба Е.А., Григорьев А.И., Коромыслов В.А. // ЖТФ. 2002. Т. 72. Вып. 1. С. 15-19
Вержбицкий В.М. Вычислительная линейная алгебра. М.: Высшая школа, 2009
Демиденко Е.З. Линейная и нелинейная регрессии. М.: Финансы и статистика. 1981.

Подсчитывается количество просмотров абстрактов ("html" на диаграммах) и полных версий статей ("pdf"). Просмотры с одинаковых IP-адресов засчитываются, если происходят с интервалом не менее 2-х часов.

Дата начала обработки статистических данных - 27 января 2016 г.

Учредители

Издатель