Вышедшие номера
Моделирование кинетических кривых полимеразной цепной реакции, полученных с помощью флуоресцентных олигонуклеотидных зондов*
Переводная версия: 10.1134/S1063784218100109
Фёдоров А.А.1, Сочивко Д.Г.2, Варламов Д.А.3, Курочкин В.Е.1
1Институт аналитического приборостроения Российской академии наук, Санкт-Петербург, Россия
2ООО "Синтол", Москва, Россия
3Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной биотехнологии, Москва, Россия
Email: f_aa@mail.ru
Поступила в редакцию: 11 января 2018 г.
Выставление онлайн: 19 сентября 2018 г.

В настоящее время имеется множество моделей полимеразной цепной реакции, в том числе претендующих на точные количественные оценки результатов реакции. При этом в подавляющем большинстве моделей кинетика накопления продукта реакции и кинетика сигнала флуоресцентного репортера считаются тождественными. Предложена модель полимеразной цепной реакции, позволяющая исследовать различие данных функций в случае использования гибридизационного зонда как источника регистрируемого флуоресцентного сигнала. Проверена адекватность модели, продемонстрировано, что кинетика накопления продукта и зондового репортера могут значительно различаться. -18
  1. Gevertz J.L., Dunn S.M., Roth C.M. // Biotechnol. and Вioengineer. 2005. Vol. 92. N 3. P. 346--355
  2. Lee J.Y., Lim H.W., Yoo S.I., Zhang B.T., Park T.H. // Biochem. Engineer. Journ. 2006. Vol. 29. N 1. P. 109--118
  3. Smith M.V., Miller C.R., Kohn M., Walker N.J., Portier C.J. // BMC Bioinformatics. 2007. Vol. 8. N 1. P. 409
  4. Cobbs G. // BMC Bioinformatics. 2012. Vol. 13. N 1. P. 203
  5. Suzuki T., Fujikura K., Higashiyama T., Takata K. // Journ. Histochemistry \& Cytochemistry. 1997. Vol. 45. P. 49--53
  6. Jones M.E., Mayne G.C., Wang T., Watson D.I., Hussey D.J. // BMC Bioinformatics. 2014. Vol. 15. P. 372
  7. Lievens A., Van Aelst S., Van den Bulcke M., Goetghebeur E. // PLoS One. 2012. Vol. 11. e47112
  8. Rutledge R.G., Stewart D. // PLoS One. 2010. Vol. 3. e9731
  9. Liu W., Saint D.A. // Anal. Biochem. 2002. Vol. 302. P. 52--59
  10. Сочивко Д.Г., Фёдоров А.А., Варламов Д.А. Курочкин В.Е., Петров Р.В. // ДАН. 2016. Т. 466. С. 109--113. [ Sochivko D.G., Fedorov A.A., Varlamov D.A., Kurochkin V.E., Petrov R.V. // Doklady Biochemistry and Biophysics. 2016. Vol. 466. P. 13--16.]
  11. Сочивко Д.Г., Фёдоров А.А., Алексеев Я.И., Курочкин В.Е., Дубина М.В. // ДАН. 2017. Т. 472. С. 726--729. [ Sochivko D.G., Fedorov A.A., Varlamov D.A., Kurochkin V.E., Petrov R.V. // Doklady Biochemistry and Biophysics. 2017. Vol. 472. P. 77--80.]

Подсчитывается количество просмотров абстрактов ("html" на диаграммах) и полных версий статей ("pdf"). Просмотры с одинаковых IP-адресов засчитываются, если происходят с интервалом не менее 2-х часов.

Дата начала обработки статистических данных - 27 января 2016 г.