Математическое моделирование линейного докинга. II. Определение влияния точечных мутаций на сродство между белковыми молекулами
Кошлан Т.В.1, Куликов К.Г.2
1Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург, Россия
2Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, Санкт-Петербург, Россия
Email: kulikov.kirill.g@gmail.com
Поступила в редакцию: 29 ноября 2017 г.
Выставление онлайн: 20 июля 2018 г.
Представлен новый метод, который позволяет качественно определять константу диссоциации пептидов к полноразмерным белкам, а также устанавливать влияние точечных мутаций в пептидах на устойчивость образованного комплекса с целыми белками. На основе разработанного подхода была выявлена качественная корреляция полученных результатов с константой диссоциации на примере образования биологического комплекса BH3-пептидов белков Bmf, Puma, Bad, Hrk, Bax, Bik, Noxa, Bid, Bim, Bak с белком Bcl-xl и BH3-пептидов белка Bax, с учетом замен аминокислотных остатков, с белком Bcl-2.
- Hong Y., Xingchang P., Zhixiu S., Shaokang W., Ligang Y., Guiju S. // Nutrients. 2014. Vol. 6. N 2. Р. 564--574
- Haiming D., Meng X.W., Scott H., Kaufmann S.H. // Cancer. Transl. Med. 2016. Vol. 2. N 1. P. 7--20
- Ding J., Zhang Z., Roberts G.J., Falcone М., Miao Y., Shao Y., Zhang X.C., Andrews D.W., Lin J.J. // Biol. Chem. 2010. Vol. 285. N 37. P. 28749--28763
- Bhat V., Olenick M.B., Schuchardt B.J., Mikles D.C., McDonald C.B., Farooq A. // Biopolymers. 2014. Vol. 101. N 6. P. 573--582
- Ku B., Liang C., Jung J.U., Oh B.H., Bonsu Ku., Chengyu L., Jae U.J., Byung-Ha O. // Cell Research. 2011. Vol. 21. P. 627--641
- Электронный ресурс. Режим доступа: http://www.uniprot.org/ (дата обращения 05.11.2017)
- Dewson G. // The Open Cell Signaling J. 2011. Vol. 3. P. 3--8
Подсчитывается количество просмотров абстрактов ("html" на диаграммах) и полных версий статей ("pdf"). Просмотры с одинаковых IP-адресов засчитываются, если происходят с интервалом не менее 2-х часов.
Дата начала обработки статистических данных - 27 января 2016 г.