Журнал технической физики
Авторам
Вышедшие номера
- 2024
- 2023
- 2022
- 2021
- 2020
- 2019
- 2018
- 2017
- 2016
- 2015
- 2014
- 2013
- 2012
- 2011
- 2010
- 2009
- 2008
- 2007
- 2006
- 2005
- 2004
- 2003
- 2002
- 2001
- 2000
- 1999
- 1998
- 1997
- 1996
- 1995
- 1994
- 1993
- 1992
- 1991
- 1990
- 1989
- 1988
Оценка влияния концентрации акриламида на диффузию биомолекул в геле
Зубик А.Н.
1, Буляница А.Л.
1, Рудницкая Г.Е.
1, Евстрапов А.А.
1
1Институт аналитического приборостроения Российской академии наук, Санкт-Петербург, Россия 
Email: tunix@yandex.ru
Поступила в редакцию: 28 февраля 2024 г.
В окончательной редакции: 7 июня 2024 г.
Принята к печати: 23 июня 2024 г.
Выставление онлайн: 24 августа 2024 г.
При количественном определении целевых молекул ДНК высокоточным методом является проведение реакции амплификации в тонком слое полиакриламидного геля. Гель затрудняет диффузию молекул ДНК, что приводит к концентрированию продуктов амплификации (ампликонов) вокруг исходной молекулы-мишени и формированию молекулярных колоний. Повышение концентрации акриламида позволяет получить более плотные гели, что позволяет уменьшить размер колоний. Уменьшение размера колоний при сохранении эффективной площади геля позволяет регистрировать большее количество колоний, увеличивая динамический диапазон метода. Для исследования влияния концентрации акриламида на диффузию ампликонов (фрагментов ДНК, получаемых в результате анализа) в геле использовали простой метод оценки коэффициента диффузии на основе регистрации движущихся границ флуоресцентно меченых биомолекул. Экспериментальная оценка влияния концентрации акриламида на диффузию синтетических олигонуклеотидов и ампликонов в геле показала, что при увеличении концентрации акриламида с 7 до 10% оценочные значения коэффициента диффузии меняются примерно в 2 раза. Ключевые слова: микрофлюидный чип, полиакриламидный гель, коэффициент диффузии, ампликон.
- А.Б. Четверин, Е.В. Четверина. Мол. биол., 36 (2), 320 (2002). [A.B. Chetverin, H.V. Chetverina. J. Mol. Biol., 36, 244 (2002). DOI: 10.1023/A:1015378108109]
- R.D. Mitra, G.M. Church. Nucleic Acids Res., 27 (24), e34 (1999). DOI: 10.1093/nar/27.24.e34
- N. Baran, S. Goldin, I. Maidanik, D. Lindell. Nat. Microbiol., 3 (1), 62 (2018). DOI: 10.1038/s41564-017-0045-y
- N.A. Sawaya, N. Baran, S. Mahank, A. Varsani, D. Lindell, M. Breitbart. Environ. Microbiol., 23 (11), 6622 (2021). DOI: 10.1111/1462-2920.15805
- Л.А. Остерман. Методы исследования белков и нуклеиновых кислот: Электрофорез и ультрацентрифугирование (Наука, М., 1981)
- Д.П. Храмцов, О.А. Сулягина, Б.Г. Покусаев, А.В. Вязьмин, Д.А. Некрасов. Теорет. основы хим. технол., 57 (1), 71 (2023). DOI: 10.31857/S0040357123010074
- W. Jiang, M. Li, Z. Chen, K.W. Leong. Lab. Chip., 16 (23), 4482 (2016). DOI: 10.1039/c6lc01193d
- B.G. Pokusaev, A.V. Vyazmin, N. Zakharov, S.S. Karlov, D.A. Nekrasov, V. Reznik, D. Khramtsov. Thermal Sci., 24 (1), 347 (2020). DOI: 10.2298/TSCI191101453P
- Д.П. Храмцов, О.А. Сулягина, А.А. Мошин. Математические методы в технологиях и технике, 9, 65 (2022). [D.P. Khramtsov, O.A. Sulyagina, A.A. Moshin. Mathem. Methods Technol. Tech., 9, 65 (2022). DOI: 10.52348/2712-8873_MMTT_2022_9_65]
- Б.Г. Покусаев, С.П. Карлов, А.В. Вязьмин, Д.А. Некрасов. Теплофизика и аэромеханика, 20 (6), 769 (2013). [B.G. Pokusaev, S.P. Karlov, A.V. Vyazmin, D.A. Nekrasov. Thermophys. Aeromechanics, 20 (6), 749 (2013). DOI: 10.1134/S0869864313060127]
- А.Я. Малкин, А.Е. Чалых. Диффузия и вязкость полимеров. Методы измерения (Химия, М., 1979)
- А.Н. Зубик, А.Л. Буляница, Г.Е. Рудницкая, А.А. Евстрапов. Тез. докл. 5-й междунар. конф. ФНЖ (СПб, Россия, 2023), с. 133
- С.А. Дубровский. Автореф. докт. дисс. (ИХФ им. Н.Н. Семенова РАН, М., 2008)
- S. Okuda, T. Iguchi, S. Nishina. Chem. Eng. J., 3 (1), 127 (1970)
- П.Дж. Хьюбер. Робастность в статистике (Мир, М., 1984) [Пер. с англ.: P.J. Huber. Robust Statistics (NY. etc., 1981)
Подсчитывается количество просмотров абстрактов ("html" на диаграммах) и полных версий статей ("pdf"). Просмотры с одинаковых IP-адресов засчитываются, если происходят с интервалом не менее 2-х часов.
Дата начала обработки статистических данных - 27 января 2016 г.
