Модель генерации флуоресцентного сигнала интеркаляционного красителя в ходе полимеразной цепной реакции
Федоров А.А.1, Сочивко Д.Г.2, Варламов Д.А.2
1Институт аналитического приборостроения Российской академии наук, Санкт-Петербург, Россия
2ЗАО "Синтол", Москва, Россия
Email: f_aa@mail.ru
Поступила в редакцию: 19 декабря 2019 г.
В окончательной редакции: 25 февраля 2020 г.
Принята к печати: 3 марта 2020 г.
Выставление онлайн: 21 мая 2020 г.
В настоящее время предложен ряд моделей полимеразной цепной реакции, имеющих своей целью получение точных количественных оценок результатов реакции. В таких моделях обычно отождествляют кинетику продукта реакции и используемого флуоресцентного репортера. Предложена модель полимеразной цепной реакции, результаты которой регистрируют с помощью интеркаляционного красителя. Анализ результатов моделирования демонстрирует заметные различия между кинетикой продукта реакции и флуоресцентным сигналом связанного интеркалятора. Ключевые слова: модель полимеразной цепной реакции, кинетическая кривая, интеркалирующий краситель.
- Higuchi R., Dollinger G., Walsh S., Griffith R. // Biotechnology 1992. Vol. 10. P. 413--417
- Higuchi R., Fockler C., Dollinger G., Watson R. // Biotechnology. 1993. Vol. 11. P. 1026--1030
- Smith M.V., Miller C.R., Kohn M., Walker N.J., Portier C.J. // BMC Bioinformatics. 2007. Vol. 8. N 1. P. 409
- Jones M.E., Mayne G.C., Wang T., Watson D.I., Hussey D.J. // BMC Bioinformatics. 2014. Vol. 15. P. 372
- Lievens A., Van Aelst S., Van den Bulcke M., Goetghebeur E. // PLoS One. 2012. Vol. 11. P. e47112
- Rutledge R.G., Stewart D. // PLoS One. 2010. Vol. 3. P. e9731
- Liu W., Saint D.A. // Anal. Biochem. 2002. Vol. 302. P. 52--59
- Федоров А.А., Сочивко Д.Г., Варламов Д.А., Курочкин В.Е. // ЖТФ. 2018. Т. 88. Вып. 10. С. 1478--1481. [ Fedorov A.A., Sochivko D.G., Varlamov D.A., Kurochkin V.E., Petrov R.V. // Tech. Phys. 2019. Vol. 63. P. 1430--1434.]
- Сочивко Д.Г., Федоров А.А., Варламов Д.А. Курочкин В.Е., Петров Р.В. // ДАН. 2016. Т. 466. С. 109--113. [ Sochivko D.G., Fedorov A.A., Varlamov D.A., Kurochkin V.E., Petrov R.V. // Doklady Biochemistry and Biophysics 2016. Vol. 466. P. 13--16.]
- Сочивко Д.Г., Федоров А.А., Алексеев Я.И., Курочкин В.Е., Дубина М.В. // ДАН. 2017. Т. 472. С. 726--729. [ Sochivko D.G., Fedorov A.A., Varlamov D.A., Kurochkin V.E., Petrov R.V. // Doklady Biochemistry and Biophysics. 2017. Vol. 472. P. 77--80.]
Подсчитывается количество просмотров абстрактов ("html" на диаграммах) и полных версий статей ("pdf"). Просмотры с одинаковых IP-адресов засчитываются, если происходят с интервалом не менее 2-х часов.
Дата начала обработки статистических данных - 27 января 2016 г.