"Журнал технической физики"
Издателям
Вышедшие номера
Дискретные бризеры в модели ДНК Пейрара-Бишопа
Фахретдинов М.И.1, Закирьянов Ф.К.1
1Башкирский государственный университет, Уфа, Россия
Email: fakhretdinovmi@pochta.ru
Поступила в редакцию: 6 марта 2012 г.
Выставление онлайн: 19 июня 2013 г.

Рассмотрена модель Пейрара-Бишопа, описывающая динамику молекулы ДНК. Для данной модели получены решения в виде дискретных бризеров. Исследована динамическая устойчивость стационарных дискретных бризеров по отношению к малым возмущениям. Найденные решения можно интерпретировать как экспериментально наблюдаемые раскрытия пар оснований в двойной спирали ДНК в начальных стадиях процесса денатурации. Показано также, что в исследуемой модели молекулы ДНК возможно существование мобильных бризеров, движущихся без возмущения окружения. Численно промоделировано взаимодействие между мобильными бризерами. Проведены оценки величины барьера Пайерлса-Набаро, а также эффективной массы и скорости бризера.
  1. Flash S., Gorbach A.V. // Phys. Rep. 2008. Vol. 467. P. 1--116
  2. Peyrard M., Bishop A.R. // Phys. Rev. Lett. 1989. Vol. 62. P. 2755
  3. Dauxois T. // Phys. Lett. A. 1991. Vol. 159. P. 390--395
  4. Forinash K., Cretegny T., Peyrard M. // Phys. Rev. E. 1997. Vol. 55. P. 4740
  5. Marin J.L., Aubry S. // Nonlinearity. 1996. Vol. 9. N 6. P. 1501
  6. Cuevas J., Archilla J.F.R., Gaididei Yu.B., Romero F.R. // Physica D. 2002. Vol. 163. P. 106--126
  7. Peyrard M., Cuesta-Lopez S., James G. // J. Biol. Phys. 2009. Vol. 35. N 1. P. 73--89
  8. James G., Levitt A., Ferreira C. // Appl. Analysis. 2010. Vol. 89. N 9. P. 1447--1465
  9. Maniadis P., Alexandrov B.S., Bishop A.R., Rasmussen K.O. // Phys. Rev. E. Vol. 33. P. 011 904--1-4
  10. Zdravkovic S., Sataric M.V. // J. Comput. and Theor. Nanoscience. 2010. Vol. 7. N 10. // P. 2031--2035
  11. Chen D., Aubry S., Tsironis G. // Phys. Rev. Lett. 1996. Vol. 77. P. 4776
  12. Alvarez A., Romero F.R., Cuevas J., Archilla J.F.R. // Lecture Notes of the Institute for Computer Sciences, Social Informatics and Telecommunications Engineering. 2009. Vol. 4. Part 1. P. 411--416

Подсчитывается количество просмотров абстрактов ("html" на диаграммах) и полных версий статей ("pdf"). Просмотры с одинаковых IP-адресов засчитываются, если происходят с интервалом не менее 2-х часов.

Дата начала обработки статистических данных - 27 января 2016 г.