Издателям
Вышедшие номера
Структуры капсидов сферических вирусов как квазикристаллические укладки
Коневцова О.В.1, Лорман В.Л.2, Рошаль С.Б.1
1Южный федеральный университет, Ростов-на-Дону, Россия
2Лаборатория им. Шарля Кулона, CNRS --- Университет Монпелье-2, Монпелье, Франция
Email: khelgla@yandex.ru
Поступила в редакцию: 2 октября 2014 г.
Выставление онлайн: 20 марта 2015 г.

Рассматрены вирусные сферические оболочки с икосаэдрической симметрией как квазикристаллические укладки. Аналогично известной теории квазиэквивалентности Каспара и Клуга данный подход также минимизирует количество конформаций, необходимых белковой молекуле для образования связей с соседями в оболочке, но основан на отличных геометрических принципах. Предполагается, что центры белковых молекул находятся в вершинах плиток с одинаковыми ребрами, а количество разных сортов плиток минимально. Получены идеализированные координаты симметрийно-неэквивалентных позиций протеинов в шести различных типах капсидов. Подход описывает единообразно как структуры, удовлетворяющие хорошо известной геометрической модели Каспара и Клуга, так и противоречащие ей. Работа выполнена при поддержке РФФИ (грант N 13-02-12085офи\_м). В.Л. благодарит Labex NUMEV за финансовую поддержку.
  • X. Huang. L.M., Bronstein, J. Retrum, C. Dufort, I. Tsvetkova, S. Aniagyei, B. Stein, G. Stucky, B. McKenna, N. Remmes, D. Baxter, C.C. Kao, B. Dragnea. Nano Lett. 7, 2407 (2007)
  • S. Aniagyai, C. Dufort, C.C. Kao, B. Dragnea. J. Mater. Chem. 18, 3763 (2008)
  • C.B. Chang, C.M. Knobler, W.M. Gelbart, T.G. Mason. ACS Nano. 2, 281 (2008)
  • F.H.C. Crick, J.D. Watson. Nature 177, 473 (1956)
  • A. Klug, D.L.D. Caspar. N.Y., Academic Press 7, 225 (1960)
  • D.L.D. Caspar, A. Klug. Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 27, 1 (1962)
  • J. Lidmar, L. Mirny, D.R. Nelson. Phys. Rev. E 68, 051 910 (2003)
  • M. Widom, J. Lidmar, D.R. Nelson. Phys. Rev. E 76, 031 911 (2007)
  • W.S. Klug, R.F. Bruinsma, J.P. Michel, C.M. Knobler, I.L. Ivanovska, C.F. Schmidt, G.J.L. Wuite. Phys. Rev. Lett. 97, 228 101 (2006)
  • R.F. Bruinsma, W.M. Gelbart, D. Reguera, J. Rudnick, R. Zandi. Phys. Rev. Lett. 90, 248 101 (2003)
  • J.E. Johnson. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 27 (1996)
  • R. Twarock. J. Theor. Biol. 226, 477 (2004)
  • T. Keef, R. Twarock, K.M. Elsawy. J. Theor. Biol. 253, 808 (2008)
  • D. Shechtman, I. Blech, D. Gratias, J.W. Cahn. Phys. Rev. Lett. 53, 1951 (1984)
  • R. Penrose. J. Inst. Math. Its. Appl. 10, 266 (1974)
  • О.V. Konevtsova, S.B. Rochal, V.L. Lorman. Phys. Rev. Lett. 108, 038 102 (2012)
  • E.F. Pettersen, T.D. Goddard, C.C. Huang, G.S. Couch, D.M. Greenblatt, E.C. Meng, T.E. Ferrin. J. Comput. Chem. 25, 1605 (2004)
  • V.L. Lorman, S.B. Rochal. Phys. Rev. B 77, 224 109 (2008)
  • O.V. Konevtsova, S.B. Rochal, V.L. Lorman. arXiv:1402.0201 (2014).
  • Подсчитывается количество просмотров абстрактов ("html" на диаграммах) и полных версий статей ("pdf"). Просмотры с одинаковых IP-адресов засчитываются, если происходят с интервалом не менее 2-х часов.

    Дата начала обработки статистических данных - 27 января 2016 г.