Оптика и спектроскопия

Авторам

Правила оформления публикаций

Вышедшие номера

2025
- 1
2024
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2023
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2022
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2021
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2020
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2019
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
2018
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

Оптическое просветление биологических тканей рядом дисахаров

DOI: 10.21883/OS.2021.06.50977.8k-21

Березин К.В.¹, Дворецкий К.Н.², Нечаев В.В.³, Новоселова А.В.¹, Лихтер А.М.¹, Шагаутдинова И.Т.¹, Грабарчук Е.В.⁴, Тучин В.В.^1,5,6

¹Саратовский национальный исследовательский государственный университет им. Н.Г. Чернышевского, Саратов, Россия Saratov State University, Saratov, Russia

Saratov State University, Saratov, Russia

²Саратовский государственный медицинский университет им. В.И. Разумовского, Саратов, Россия Saratov State Medical University named after V. I. Razumovsky, Saratov, Russia

Saratov State Medical University named after V. I. Razumovsky, Saratov, Russia

³Саратовский государственный технический университет имени Гагарина Ю.А., Саратов, Россия Yuri Gagarin State Technical University of Saratov, Saratov, Russia

Yuri Gagarin State Technical University of Saratov, Saratov, Russia

⁴Астраханский государственный университет, Астрахань, Россия Astrakhan State University, Astrakhan, Russia

⁵Институт проблем точной механики и управления РАН, Саратов, Россия Institute of Precision Mechanics and Control, Russian Academy of Sciences, Saratov, Russia

Institute of Precision Mechanics and Control, Russian Academy of Sciences, Saratov, Russia

⁶Национальный исследовательский Томский государственный университет, Томск, Россия Tomsk State University, Tomsk, Russia

Поступила в редакцию: 15 декабря 2020 г.

В окончательной редакции: 12 февраля 2021 г.

Принята к печати: 26 февраля 2021 г.

Выставление онлайн: 26 марта 2021 г.

PDF версия

Методами классической молекулярной динамики (GROMACS), молекулярного докинга (AutoDock Vina) и квантовой химии (PM6 и DFT/B3LYP) исследовано взаимодействие пяти иммерсионных агентов на основе растворов дисахаров (сахарозы, мальтозы, лактозы, трегалозы и целлобиозы) с миметическим пептидом коллагена (GPH)₃ как одним из основных компонентов биологических тканей. В результате комплексного молекулярного моделирования для этих агентов предсказаны такие параметры, как потенциал оптического просветления для кожи крысы и эффективность оптического просветления для кожи человека. Обсуждаются причины значительного различия в значениях параметров оптического просветления иммерсионных агентов, принадлежащих к одной молекулярной группе. Ключевые слова: оптическое просветление биотканей, молекулярная динамика, молекулярный докинг, квантовая химия.

Hirshburg J.M., Ravikumar K.M., Hwang W., Yeh A. // J. Biomed. Opt. 2010. V. 15. N 5. P. 055002. doi 10.1117/1.3484748
Тучин В.В. Оптика биологических тканей. Методы рассеяния света в медицинской диагностике, 2-е издание. М.: Физматлит, 2012. 811 с.; Tuchin V.V. Tissue Optics: Light Scattering Methods and Instruments for Medical Diagnosis (SPIE Press Monograph. V. PM166) Second Edition. SPIE Publications, 2007. 882 p
Tuchin V.V. Optical Clearing of Tissues and Blood (SPIE Press Monograph. V. PM154). SPIE Publications, 2005. 256 p
Zhu D., Larin K.V., Luo Q., Tuchin V.V. // Laser Photonics Rev. 2013. V. 7. N 5. P. 732. doi 10.1002/lpor.201200056
Genina E.A., Bashkatov A.N., Sinichkin Yu.P., Yanina I.Yu., Tuchin V.V. // J. Biomed. Photonics \& Eng. 2015. V. 1. N 1. P. 22. doi 10.18287/jbpe-2015-1-1-22
Oliveira L.M.C., Tuchin V.V. The Optical Clearing Method: A New Tool for Clinical Practice and Biomedical Engineering. Basel: Springer Nature Switzerland AG, 2019. 177 p
Matryba P., Kaczmarek L., Golab J. // Laser \& Photon. Rev. 2019. V. 13. N 8. P. 1800292. doi 10.1002/lpor.201800292
Ueda H.R., Erturk A., Chung K., Gradinaru V., Chedotal A., Tomancak P., Keller P.J. // Nat. Rev. Neurosci. 2020. V. 21. N 2. P. 61. doi 10.1038/s41583-019-0250-1
Hirshburg J., Choi B., Nelson J.S., Yeh A.T. // Las. Surg. Medicine. 2007. V. 39. N 2. P. 140. doi 10.1002/lsm.20417
Sdobnov A.Y., Darvin M.E., Genina E.A., Bashkatov A.N., Lademann J., Tuchin V.V. // Spectrochim. Acta A. 2018. V. 197. P. 216. doi 10.1016/j.saa.2018.01.085
Tuchina D.K., Shi R., Bashkatov A.N., Genina E.A., Zhu D., Luo Q., Tuchin V.V. // J. Biophotonics. 2015. V. 8. N 4. P. 332. doi 10.1002/jbio.201400138
Wen X., Mao Z., Han Z., Tuchin V.V., Zhu D. // J. Biophotonics. 2010. V. 3. N 1-2. P. 44. doi 10.1002/jbio.200910080
Hirshburg J.M. Chemical agent induced reduction of skin light scattering: doctoral dissertation. Texas A\&M University, 2009. P. 119
Feng W., Shi R., Ma N., Tuchina D.K., Tuchin V.V., Zhu D. // J. Biomed. Opt. 2016. V. 21. N 8. P. 081207. doi 10.1117/1.JBO.21.8.081207
Berezin K.V., Dvoretski K.N., Chernavina M.L., Likhter A.M., Smirnov V.V., Shagautdinova I.T., Antonova E.M., Stepanovich E.Yu., Dzhalmuhambetova E.A., Tuchin V.V. // J. Mol. Modeling. 2018. V. 24. N 2. P. 45. doi 10.1007/s00894-018-3584-0
Березин К.В., Дворецкий К.Н., Чернавина М.Л., Нечаев В.В., Лихтер А.М., Шагаутдинова И.Т., Aнтонова E.M., Тучин В.В. // Опт. и спектр. 2019. Т. 127. В. 8. С. 329. doi 10.21883/OS.2019.08.48051.29-19; Berezin K.V., Dvoretski K.N., Chernavina M.L., Nechaev V.V., Likhter A.M., Shagautdinova I.T., Antonova E.M., Tuchin V.V. // Opt. Spectrosc. 2019. V. 127. N 8. P. 352. doi 10.1134/S0030400X19080071
Bashkatov A.N., Berezin K.V., Dvoretskiy K.N., Chernavina M.L., Genina E.A., Genin V.D., Kochubey V.I., Lazareva E.N., Pravdin A.B., Shvachkina M.E., Timoshina P.A., Tuchina D.K., Yakovlev D.D., Yakovlev D.A., Yanina I.Yu., Zhernovaya O.S., Tuchin V.V. // J. Biomed. Opt. 2018. V. 23. N 9. P. 091416. doi 10.1117/1.JBO.23.9.091416
Yu T., Wen X., Tuchin V.V., Luo Q., Zhu D. // J. Biomed. Opt. 2011. V. 16. N 9. P. 095002. doi 10.1117/1.3621515
Okuyama K., Miyama K., Mizuno K., Bachinger H.P. // Biopolymers. 2012. V. 97. N 8. P. 607. doi 10.1002/bip.22048
Cornell W.D., Cieplak P., Bayly C.I., Gould I.R., Merz K.M.Jr., Ferguson D.M., Spellmeyer D.C., Fox T., Caldwell J.W., Kollman P.A. // J. Am. Chem. Soc. 1995. V. 117. N 19. P. 5179. doi 10.1021/ja00124a002
Becke A.D. // J. Chem. Phys. 1993. V. 98. N 7. P. 5648. doi 10.1063/1.464913
Lee C., Yang W., Parr R.G. // Phys. Rev. B. 1988. V. 37. N 2. P. 785. doi 10.1103/PhysRevB.37.785
Frisch M.J., Trucks G.W., Schlegel H.B. et al. Gaussian09, Revision A.02. Pittsburgh PA: Gaussian, Inc. 2009
van der Spoel D., Lindahl E., Hess B., Groenhof G., Mark E.A., Berendsen H.J.C. // J. Comput. Chem. 2005. V. 26. N 16. P. 1701. doi 10.1002/jcc.20291
Duan Y., Wu C., Chowdhury S., Lee M.C., Xiong G., Zhang W., Yang R., Cieplak P., Luo R., Lee T., Caldwell J., Wang J., Kollman P. // J. Comp. Chem. 2003. V. 24. N 16. P. 1999. doi 10.1002/jcc.10349
Berendsen H.J.C., Postma J.P.M., van Gunsteren W.F., DiNola A., Haak J.R. // J. Chem. Phys. 1984. V. 81. N 8. P. 3884. doi 10.1063/1.448118
Humphrey W., Dalke A., Schulten K. // J. Mol. Graph. 1996. V. 14. N 1. P. 33. doi 10.1016/0263-7855(96)00018-5
Loof H.D., Nilsson L., Rigler R. // J. Am. Chem. Soc. 1992. V. 114. N 11. P. 4028. doi 0.1021/ja00037a002
Stewart J.J.P. // J. Mol. Model. 2007. V. 13. N 12. P. 1173. doi 10.1007/s00894-007-0233-4
Trott O., Olson A.J. // J. Comp. Chem. 2010. V. 31. N 2. P. 455. doi 10.1002/jcc.21334

Подсчитывается количество просмотров абстрактов ("html" на диаграммах) и полных версий статей ("pdf"). Просмотры с одинаковых IP-адресов засчитываются, если происходят с интервалом не менее 2-х часов.

Дата начала обработки статистических данных - 27 января 2016 г.

Учредители

Издатель