Развитие технологий de novo синтеза ДНК позволяет формировать сложные искусственные оптические биосовместимые конструкции, начиная от простых флуоресцентных белков и заканчивая сенсорами физиологических и биохимических параметров, работающими непосредственно in vivo и меняющими свои оптические свойства под действием физических и химических факторов окружения или действия ферментов. В то же время поскольку такие конструкции зачастую содержат сильно повторяющийся код ДНК, то с высокой степенью вероятности в процессе синтеза происходит некорректное присоединение отдельных олигонуклеотидов в целевую последовательность, в результате чего формируются неспецифические побочные продукты и падает выход целевых последовательностей, что иногда делает невозможным саму сборку, трансляцию в белки и дальнейшую работу таких искусственных генетических конструкций. В нашей работе мы, используя технологию выравнивания генетических последовательностей, находим такие нецелевые результаты синтеза непосредственно in silico (до синтеза реальных конструкций), что позволяет изменить параметры разбивки последовательности на олигонуклеотиды таким образом, чтобы максимизировать выход целевой последовательности и уменьшить возможность формирования побочных нецелевых продуктов. Ключевые слова: cборка ДНК, флуоресцентные белки, искусственные генетические конструкции, олигонуклеотиды, гель-электрофорез, моделирование, выравнивание последовательностей ДНК. DOI: 10.21883/0000000000

Подсчитывается количество просмотров абстрактов ("html" на диаграммах) и полных версий статей ("pdf"). Просмотры с одинаковых IP-адресов засчитываются, если происходят с интервалом не менее 2-х часов.

Дата начала обработки статистических данных - 27 января 2016 г.