Анализ влияния флуоресцентных красителей на комплексообразование азотсодержащих аминокислот
Российский научный фонд, 25-22-00258
Назарьев Е.В.
1, Пластун И.Л.
11Саратовский государственный технический университет имени Гагарина Ю.А., Саратов, Россия

Email: agexxxecute@gmail.com, inna_pls@mail.ru
Поступила в редакцию: 26 ноября 2025 г.
В окончательной редакции: 26 января 2026 г.
Принята к печати: 27 марта 2026 г.
Выставление онлайн: 25 июня 2026 г.
Одним из значимых направлений в современной фармакологии является создание лекарственных препаратов на основе биосовместимых белковых структур и таргетная терапия на основе белковых капсул доставки. Критически важной задачей в этом контексте является отслеживание транспорта белкового комплекса по организму in vivo. В представленной статье рассматриваются квантово-химические механизмы взаимодействия белковых структур в процессе диагностики их транспорта с использованием флуоресцентных красителей. При этом важно, чтобы присутствие красителя не ослабляло взаимодействия между белковыми составляющими лекарственного препарата и белком-мишенью. Поскольку взаимодействие белковых структур определяется контактами между аминокислотными остатками, цель данного исследования - оценить влияние флуоресцентных красителей на комплексообразование между азотсодержащими аминокислотами, которые в этом взаимодействии играют ключевую роль. Результаты показали, что флуоресцентные красители могут по-разному влиять на нековалентное взаимодействие белковых структур: флуоресцеин и индигокармин не ослабляют, а существенно усиливают межмолекулярное взаимодействие как для основных, так и для нейтральных аминокислот, а метиленовый синий продемонстрировал противоположный эффект, ослабив связь в паре основных аминокислот, хотя и усилил взаимодействие нейтральных. Таким образом, в ходе применения флуоресцентных красителей для диагностики транспорта вещества in vivo в белковых структурах, основанных на нековалентном взаимодействии, необходимо учитывать особенности взаимодействия каждого конкретного красителя с учетом полярности. Ключевые слова: теория функционала плотности, молекулярные структуры, ИК-спектры, водородные связи, аминокислоты, красители, нековалентное взаимодействие.
- K. Luck et. al. Nature, 580 (7803), 402 (2020). DOI: 10.1038/s41586-020-2188-x
- D. Rolf, T. Inaki, L. Damien. Am Chem Soc., 146 (20), 14213 (2024). DOI: 10.1021/jacs.4c03445
- Я. Кольман, К.-Г. Рем. Наглядная биохимия (Лаборатория знаний, М., 2019), с. 66--67
- П.А. Гервас, Н.В. Литвяков, Н.О. Попова, А.Ю. Добродеев, А.С. Тарасова, Е.Л. Юмов, Ф.Г. Иванова, О.В. Черемисина, С.Г. Афанасьев, В.Е. Гольдберг, Н.В. Чердынцева. Сиб. онкол. журн., 62 (2), 46 (2014)
- Г.Н. Тен, Н.Е. Щербакова, В.И. Баранов. Колебательные спектры аминокислот в разных фазовых состояниях (Изд-во Саратовского ун-та, С., 2017), 188 с
- Г.Н. Тен, Н.Е. Щербакова, В.И. Баранов. Естественные науки, 3 (60), 85 (2017)
- M.-E. Ristea, O. Zarnescu. J. Xenobiot., 13 (4), 509 (2023). DOI: 10.3390/jox13040032
- A. Fernandez-Perez, G. Marban. ACS Omega, 5 (46), 29801 (2020). DOI: 10.1021/acsomega.0c03830
- Z. Zhao, E.R. Malinowski. J. Chemometrics, 13 (2), 83 (1999). DOI: 10.1366/0003702991946028
- W. Kohn. Rev. Mod. Phys., 71 (5), 1253 (1999). DOI: 10.1103/RevModPhys.71.1253
- A.D. Becke. J. Chem. Phys., 98 (7), 5648 (1993). DOI: 10.1063/1.464913
- M.J. Frisch, G.W. Trucks, H.B. Schlegel et al. Gaussian 03, Revision B.03 (Gaussian, Inc., Pittsburgh, PA, 2003)
- А.В. Иогансен. Водородная связь (Наука, М., 1981), 155 с
- J.W. Steed, J.L. Atwood. Supramolecular Chemistry, 2nd ed. (John Wiley \& Sons, Chichester, 2009), 970 p
- FreeSpectralDatabase [Электронный ресурс]. URL: https://spectrabase.com/compound/5G3SgzEul7q
- FreeSpectralDatabase [Электронный ресурс]. URL: https://spectrabase.com/compound/CLtDf3EKtRq
- FreeSpectralDatabase [Электронный ресурс]. URL: https://spectrabase.com/compound/FNTSDUMClVl
- FreeSpectralDatabase [Электронный ресурс]. URL: https://spectrabase.com/compound/K1B2HAWMHQJ
- FreeSpectralDatabase [Электронный ресурс]. URL: https://spectrabase.com/compound/6OrTtwllZsb
- FreeSpectralDatabase [Электронный ресурс]. URL: https://spectrabase.com/compound/8yty4gvbDYX
- FreeSpectralDatabase [Электронный ресурс]. URL: https://spectrabase.com/spectrum/1m3Z6HLFXyu
Подсчитывается количество просмотров абстрактов ("html" на диаграммах) и полных версий статей ("pdf"). Просмотры с одинаковых IP-адресов засчитываются, если происходят с интервалом не менее 2-х часов.
Дата начала обработки статистических данных - 27 января 2016 г.